Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Rnf144aQ925F3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms