Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gon4l-201ENSMUST00000081695 7440 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gon4l-202ENSMUST00000090942 7443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pml-201ENSMUST00000085673 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Tpp2-207ENSMUST00000188313 4631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
SptssbQ925E8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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