Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Csmd1Q923L3 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms