Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp3Q91W36 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Usp3Q91W36 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp3Q91W36 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms