Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Thoc3Q8VE80 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Thoc3Q8VE80 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Thoc3Q8VE80 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms