Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rprd1aQ8VDS4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rprd1aQ8VDS4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms