Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ApobrQ8VBT6 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ApobrQ8VBT6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms