Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms