Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Cdkl1Q8CEQ0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Cdkl1Q8CEQ0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms