Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc28aQ8CEI3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms