Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufl1Q8CCJ3 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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