Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cacnb2Q8CC27 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cacnb2Q8CC27 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cacnb2Q8CC27 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cacnb2Q8CC27 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Cacnb2Q8CC27 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cacnb2Q8CC27 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms