Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ephb1Q8CBF3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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