Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atg4aQ8C9S8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Atg4aQ8C9S8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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