Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms