Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan12Q8BKT6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms