Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Usp1Q8BJQ2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Usp1Q8BJQ2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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