Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Q8BGC1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Q8BGC1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Q8BGC1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q8BGC1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q8BGC1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q8BGC1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q8BGC1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q8BGC1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Q8BGC1 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8BGC1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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