Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms