Protein–RNA interactions for Protein: Q80TN7

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Length 2,359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav3Q80TN7 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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Nav3Q80TN7 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Nav3Q80TN7 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Nav3Q80TN7 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nav3Q80TN7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nav3Q80TN7 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nav3Q80TN7 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nav3Q80TN7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Nav3Q80TN7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Nav3Q80TN7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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