Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
NischQ80TM9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NischQ80TM9 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
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