Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
IfnkQ7TSL0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms