Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Dsg1cQ7TSF0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms