Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rph3alQ768S4 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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