Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trak1Q6PD31 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trak1Q6PD31 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms