Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Krt40Q6IFX3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Krt40Q6IFX3 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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