Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Pkp4Q68FH0 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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