Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ifit1Q64282 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms