Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Trim24Q64127 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms