Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms