Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Psmb6Q60692 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Psmb6Q60692 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms