Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprnQ60673 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms