Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lrrc43Q3V0L5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Lrrc43Q3V0L5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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