Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Chpf2Q3UU43 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Chpf2Q3UU43 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Chpf2Q3UU43 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Chpf2Q3UU43 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Chpf2Q3UU43 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chpf2Q3UU43 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms