Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Znf48Q3US17 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Znf48Q3US17 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Znf48Q3US17 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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