Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 4930589L23Rik-201ENSMUST00000091023 1364 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Shisa3Q3UPR0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Shisa3Q3UPR0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Shisa3Q3UPR0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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