Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Ulk3Q3U3Q1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms