Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm12932-201ENSMUST00000143705 620 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 AC107711.6-201ENSMUST00000228455 1088 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Defb6-201ENSMUST00000063112 323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm46199-201ENSMUST00000220373 1693 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm43802-201ENSMUST00000197826 637 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 AC153937.3-201ENSMUST00000217814 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm28533-202ENSMUST00000190106 1346 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Kctd1-201ENSMUST00000025992 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Fam117bQ3U3E2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms