Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tmem88bQ3TYP4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem88bQ3TYP4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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