Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Srsf6Q3TWW8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms