Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rtl9Q32KG4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms