Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd2Q149F1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd2Q149F1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms