Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Traf3ip1Q149C2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms