Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Itgb8Q0VBD0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms