Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Cntnap5cQ0V8T7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms