Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Cnn1Q08091 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms