Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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Sh3bp2Q06649 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Sh3bp2Q06649 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms