Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Runx1Q03347 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms