Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pax8Q00288 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pax8Q00288 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms