Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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